合理浇水：在芸豆的幼苗期少浇水，见干见湿即可，芸豆结荚后，需要适当增加浇水频率。露地栽培的芸豆需要在雨季合理安排灌溉时间，还需要及时排出田间积水。防治根腐病：实行轮作栽培芸豆，同时将有机肥和化肥结合施肥。还可以用多菌灵、治萎灵、防霉宝、菌枯灵、敌克松等药剂进行灌根，来防治芸豆根腐病。
一、芸豆烂根死秧原因
1、水分过多
芸豆烂根死秧的原因可能是土壤湿度过大，浇水过于频繁，导致土壤中的水分排水不畅。或者水分还没有被根系完全吸收，就又产生积水，这样下去芸豆就会因为沤根而窒息腐烂，造成地上部死秧。
2、感染病害
芸豆的根腐病也会导致芸豆烂根死秧。芸豆根腐病是土传病害，可以从根系开始腐蚀芸豆，然后随着病株、雨水等逐渐传播到其它植株的根系。芸豆发病严重之后，植株根系腐烂，地上部萎焉死秧。
二、芸豆烂根死秧防治方法
1、合理浇水
幼苗期的芸豆不需要浇太多水，见干见湿即可。等到根系发育完全开始结荚时，可以适当增加浇水频率。露天栽培的芸豆还需要注意在雨季少浇水，并及时排水。
2、防治根腐病
最好不要在重茬播种的地块种植芸豆，而且不能偏施氮肥，能够预防芸豆根腐病。芸豆根腐病发病以后，可以用多菌灵、治萎灵、防霉宝、菌枯灵、敌克松、根病灵等药剂进行灌根消毒，每10天灌根一次，连续灌根2-3次。