(一)热处理
数世纪前，人们就开始利用木炭来对宝石进行热处理了。他们会把宝石扔进木炭的火堆中“烧煮”以增强或改变宝石的颜色和透明度。当今，随着科技的进步，人们可以通过精密的设备来增强或改变宝石的颜色和透明度。无论是以前的古老方法还是现今的先进技术设备，都是为把暗淡无光的宝石变得光艳四射，从而让消费者可以很自豪的将所拥有的宝石展示人前。
热处理被认为是一种自然的改善宝石颜色的处理方式，是由于它是宝石当初在地质形成过程中的热力作用的延续。在热处理的过程中，宝石会被加热到大约1600摄氏度，从而消除宝石内部的杂质、改变宝石内部的化学元素或使得宝石的颜色改变。经过热处理后，宝石的颜色会变得更深或更浅，甚至会跟处理前完全不一样。常见的例子就是，蓝宝经过热处理可以把内部金红石针状的杂质消除，使得蓝宝增色和提高透明度。宝石经过了热处理之后所产生的颜色是稳定和不可再改变的。
热处理的另一个常见例子就是红宝。一般来说，红宝都会经过热处理的，只有那些颜色最红艳和价格不菲的红宝才不会经过热处理的。红宝在热处理的过程中几乎会被加热到它的熔点，使得红宝内部的氧化铝重组，同时让红宝内部的铬与不同的原子组合，从而形成新的晶体结构。同样的热处理方法也被应用到闻名的高达蓝宝石，热处理使得奶白色宝石的颜色变成蓝色，因此在现今的宝石市场上出现不同等级的蓝宝石。
热处理之所以被接受是也因为这种处理可以改变宝石内部自然产生的杂质。通过热处理可以破坏宝石内部的汽体或液体杂质。红宝石在热处理的过程中，经常被加入以硼砂为主的化学物品，以使得红宝石表面的裂痕“愈合”。
但是，一般情况下，要知道一颗宝石是否经过热处理是比较困难的。到底如何辨识宝石是否经过热处理呢?宝石学家利用显微镜，通过检查和研究宝石内部的杂质以作为识别它是否有经过热处理的迹象。例如，红宝石在热处理的过程中，经常通过加入以硼砂为主的化学物品以使得红宝表面的裂痕“愈合”。也因为这些化学物品的使用，令红宝经过热处理后会出现一些玻璃状的杂质。
(二)铍处理
铍处理是近期用于处理宝石的一种新增技术。铍处理主要应用于蓝宝石，它其实也算是热处理中的一种， 但在加热的过程中会加入铍元素，学界就将它定义为铍处理。由于很多的宝石内部原子结构都含有铍元素，例如祖母绿、绿玉、海蓝宝、金绿玉，所以宝石界业者对铍元素非常熟悉。通过在加热过程中加入铍元素，可以让宝石增色。
传统的扩散处理只是能改变宝石表面的颜色，相比之下，铍处理可以改变整颗宝石的颜色，使得经过铍处理的宝石可以根据需要被切割。
经过轮番的争辩，铍处理现在已经被业界广泛认可。但是，商家在出售经过铍处理的宝石时，必须将铍处理向买家披露。
(三)扩散处理
然而，因为扩散处理可以使宝石产生和增加星彩效果，所以扩散处理普遍用于星彩宝石和经过扩散处理的星彩宝石是可以进行买卖的。但是，鉴于扩散处理只是会改变宝石表层的颜色，所以经过扩散处理的星彩宝石是不可以再被切割或打磨的，因为再切割或打磨可以把扩散处理产生的颜色去掉。对大部分的买家而言，一旦将宝石镶嵌到珠宝上，他们就不会再将宝石再切割或打磨。特别是蓝宝石，它们是很坚硬的，所以他们不容易被刮花。
(四)裂痕处理
彩色宝石的小面积裂痕或断面可以通过注入某些化学物质而使得裂痕或断面得到“愈合”。注入油、蜡、玻璃、环氧树脂、硼砂等不同化学物质，可以使得一些裂到彩宝表面的裂痕通过化学物质的注入变得很隐蔽甚至得到“愈合”。没有光学工具的辅助，是很难观察到那些微小的孔里面曾经被注入了化学物质。正正也是这个原因，让买家必须提防这种裂痕处理。最普遍用到这种处理的宝石包括：祖母绿、海蓝宝、红宝、蓝宝、 橄榄石和松石。因为祖母绿天然形成时会产生很多裂痕或断裂面，所以被注入油的祖母绿在业界是被接受的。
(五)辐射处理
事实上，现在的市场上每一颗蓝晶都经过辐射处理。天然的蓝晶是非常非常罕有，并且颜色是十分浅的。人们所喜欢的蓝晶都是通过将透明度很高的黄玉吸收一系列由加速器放射出来的电子或者由核反应堆辐射出来的冲子而产生的。根据辐射的持续时间、吸收的放射性元素和事后的热处理过程，会形成从天空蓝到瑞士蓝然后到伦敦蓝等不同颜色的蓝晶。虽然经过辐射处理的彩色宝石会残留一些辐射，但相应的持续时间是相当短的。在美国或者其他用辐射处理彩色宝石的国家，他们都有很严格的规则来确保经过辐射处理的彩宝是不会向公众释放辐射的。