如何数佛珠是有讲究的，并不是从头数到尾就算结束，念言的同时还要抚摸，而且数佛珠要有顺序的进行。
念珠主要是用来念佛号的，譬如念「南无阿弥陀佛」或「南无观世音菩萨」等，念时食指与大拇指握住某颗佛珠时，嘴巴用金刚持法微声念出佛号，同时大拇指轻轻地在佛珠上摸压绕表面一周，以摸完时也刚好念完佛号的速度摸之，念完后把佛珠拨进来手掌心中，继续再念下一声佛号。当念佛念到最后一颗佛珠时，就要再转回头来数，不要超越有佛像头的那颗佛头珠，意思是说手指、手掌不要超那颗镶嵌有佛像者，当然也有没佛像的头珠。最后念佛绕几圈，当知道念了几遍的佛号了。
念佛法门也是非常殊胜的，但若不了解方法，当然就不会有大进步。行者用金刚持时，除注意手与嘴巴的动作外，也应要将耳朵仔细听嘴巴念佛的声音，眼睛注意看手摸佛珠的动作，鼻子呼吸自然不着。如此诸根用上：会念佛的是意根，眼耳、鼻舌、身意等六根都在念佛的动作与嘴巴上，这就是都摄六根，如此用功，就会达净念相继的地步。