胸部CT是一种无创伤的影像学检查，随着成像技术的不断进步，CT的分辨率越来越高，不但可以清楚地显示肺和纵隔各个横断面的细微结构，还可借助造影剂显示出病灶的血供情况。与X线胸片相比，胸部CT可发现胸片不能发现的小病灶，以及被正常组织遮盖的病灶。
不过，CT检查也有局限——无法定性。就像“以貌取人”会犯错一样，即使医生的经验再丰富，也会有判断失误的时候。比如，有的病灶从CT片上看像肿瘤，其实是炎性假瘤、结核或真菌感染，有的病灶从CT片上看像肺炎或结核，其实是肺癌。气管镜检查的最大优势就是可以定性。医生不仅可以在镜下观察气管、支气管腔内有无异常，还可采样进行病原或病理检查，明确病灶性质。
通常情况下，胸部CT和气管镜检查是相辅相成的。医生一般会根据胸部CT检查的结果，初步判断病灶的性质。若怀疑是普通炎症性病变，通常先进行一段时间的抗炎治疗，随后复查。若复查后发现病灶吸收，则无需再做气管镜检查；若复查后发现病灶未吸收，则需做气管镜检查。若胸部CT检查提示病灶恶性的可能性很大，或高度怀疑是特殊感染（如结核、真菌感染），抑或是经验治疗效果不佳时，则应尽早做气管镜检查。